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Par Michael Haederle

Variation virale

Des scientifiques de l'UNM détectent une nouvelle mutation du SRAS-CoV-2 au Nouveau-Mexique

Les scientifiques ont découvert que le SRAS-CoV-2 était un adversaire rusé depuis qu'il a été identifié pour la première fois en Chine il y a un peu plus d'un an, le nouveau coronavirus démontrant une capacité obstinée à muter alors qu'il tente d'échapper au système immunitaire humain.

Une paire de scientifiques de l'Université du Nouveau-Mexique a trouvé des preuves qu'une nouvelle variante virale, appelée Q677P, est apparue au Nouveau-Mexique et dans les États occidentaux voisins au cours des derniers mois – tandis qu'une mutation identique est apparue dans des échantillons prélevés en Louisiane.

Dans un article publié cette semaine sur medRxiv, le serveur de préimpression en ligne pour les sciences de la santé, Darrell Dinwiddie, PhD, professeur adjoint au Département de pédiatrie, et Daryl Domman, PhD, professeur adjoint au Center for Global Health, rapportent que les mutations ont été trouvées sur la protéine « spike », une caractéristique distinctive qui joue un rôle clé en aidant le virus à accéder aux cellules hôtes. Le couple a été rejoint dans l'étude par des collègues de l'UNM et des co-auteurs en Louisiane, à New York, en Pennsylvanie, au Wyoming et en Suisse.

Il n'est pas clair à ce stade si la variation nouvellement identifiée dans le génome du virus augmente sa transmissibilité. "C'est quelque chose que nous devons surveiller pour savoir si c'est le cas", a déclaré Domman.

Les nouvelles découvertes soulignent l'importance d'une surveillance génomique continue pour voir comment le virus se modifie. Sans cela, dit Domman, « nous sommes un peu aveugles pour comprendre comment le virus réagit à nos mesures de contrôle. »

Ils sont également un rappel qui donne à réfléchir de ce à quoi les scientifiques sont confrontés, dit Domman. «Cela souligne le fait que, comme nous avons un nombre de cas plus élevé, aux niveaux local, régional et national, chacun de ces nouveaux cas est une nouvelle opportunité pour le virus d'explorer et d'avoir une mutation et d'être un peu meilleur que la dernière fois. . "

Lorsqu'ils se reproduisent à l'intérieur d'une cellule hôte, les virus modifient constamment de petites portions de leur génome pour se défendre contre les anticorps créés par le système immunitaire pour les neutraliser – les variations annuelles du virus de la grippe en sont un exemple bien connu. Dans le coronavirus, ces nouvelles mutations posent des défis pour la conception d'un vaccin efficace.

Des mutations ont été trouvées à des endroits similaires sur la protéine de pointe COVID dans d'autres parties du monde, a déclaré Dinwiddie, ajoutant: "Ce n'est pas une surprise que la pointe soit l'endroit où bon nombre de ces variantes se produisent."

Pendant une grande partie de l'année écoulée, Dinwiddie et Domman ont séquencé, déposé et surveillé les génomes du SRAS-CoV-2 enregistrés dans GISAID, une base de données internationale qui offre un accès ouvert à près de 500,000 XNUMX génomes de coronavirus collectés dans le monde entier.

Ils ont découvert que 11.3% des génomes collectés au Nouveau-Mexique entre décembre 2020 et janvier 2021 reflètent la nouvelle variante. Cependant, il n'est pas unique à l'État et a également été observé dans le Colorado, le Wyoming et le Texas. Des mutations supplémentaires à la même position dans la protéine de pointe sont trouvées dans le monde entier et semblent s'être produites indépendamment - un cas, disent-ils, de ce que l'on appelle une évolution convergente.

Alors que le jury ne sait pas si les nouvelles variantes augmentent la transmissibilité du coronavirus, on craint que des mutations dans la protéine de pointe puissent réduire l'efficacité des vaccins nouvellement introduits, dit Dinwiddie.

« Les vaccins sont conçus pour ne pas attaquer simplement un seul endroit dans une protéine », dit-il, mais « la preuve est que nous constatons une protection réduite contre certains de ces changements de pointe avec certains de ces vaccins. »

La bonne nouvelle est que la technologie innovante d'ARN messager qui a été utilisée pour développer rapidement les vaccins permet également aux fabricants de médicaments de les peaufiner pour reconnaître et se défendre contre les nouvelles souches virales, dit-il.

Domman note : « Notre meilleur outil pour garantir que nos vaccins restent efficaces est de réduire le nombre de cas. » Et en fin de compte, cela se traduit par les mêmes vieilles veilles : port de masques, lavage minutieux des mains et maintien de la distance physique.

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