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Par Michael Haederle

Faire la lumière sur le génome obscur

Les protéines nouvellement décrites mènent à de nouvelles thérapies médicamenteuses prometteuses

Au lycée, on nous a appris que des milliers de protéines différentes donnent forme aux cellules de notre peau, de nos muscles, de nos nerfs, de nos organes et de nos tissus conjonctifs. Chaque protéine est construite à partir d'une chaîne d'acides aminés selon une matrice codée dans notre ADN - le génome.

Alors que les scientifiques ont enregistré avec succès la plupart des quelque trois milliards de "lettres" du génome humain, ils n'ont pas complètement démêlé le "protéome" - l'ensemble correspondant de protéines dans le corps. En fait, près d'une protéine sur trois n'a pas été caractérisée en détail, et plus de 6,000 XNUMX protéines codées par ce génome "sombre" restent en grande partie non étudiées.

La quête pour mieux comprendre le génome sombre - et peut-être découvrir de nouveaux traitements pour la maladie - est depuis longtemps une passion motrice pour Tudor Oprea, MD, PhD, professeur et chef de la division d'informatique translationnelle du département de médecine interne de l'Université du Nouveau-Mexique.

"Seules environ 3,000 15 protéines humaines sont bien étudiées et bien comprises", déclare Oprea. "Pensez-y - nos manuels de pharmacologie et de biochimie couvrent environ XNUMX pour cent du protéome humain. Beaucoup plus de travail est nécessaire pour compléter le reste du puzzle."

Oprea est un chercheur de premier plan dans le projet Illuminating the Druggable Genome (IDG), financé par les National Institutes of Health. Il comprend des chercheurs américains de l'Université de Californie à Davis, de l'Université de Californie à San Francisco, de l'Université de Caroline du Nord à Chapel Hill, de l'Université de Washington à St. Louis, de la Icahn School of Medicine de Mount Sinai, de l'Université de Miami et du Massachusetts General. Hospital, ainsi que des collaborateurs en Angleterre, au Danemark, en Roumanie et en Inde.

Au cours des deux premiers mois de cette année, Oprea a reçu une continuation de 1 million de dollars de sa subvention pluriannuelle pour le Centre de gestion des connaissances IDG, et il partagera également une nouvelle récompense de 588,000 XNUMX $ avec un collègue du Jackson Laboratory à Bar Harbor, Maine.

Oprea et Larry Sklar, PhD, professeur distingué au département de pathologie de l'UNM, Maralyn S. Budke et Robert E. Anderson Distinguished Endowed Chair in Cancer Drug Discovery et directeur du UNM Center for Molecular Discovery, également partenaire d'un collègue de l'Université de l'École de médecine de Miami au Centre de diffusion et de sensibilisation des ressources de l'IDG.

L'année dernière, le centre de gestion des connaissances IDG d'Oprea a proposé un élégant schéma en quatre parties pour catégoriser le génome en fonction de l'étendue de l'étude des gènes - et des protéines pour lesquelles ils codent -.

Jusqu'à présent, le déficit de connaissances a eu tendance à se perpétuer, car les scientifiques sont plus susceptibles de recevoir des fonds pour étudier les zones du génome qui sont déjà relativement bien décrites - un peu comme l'homme ivre cherchant ses clés sous le réverbère parce que c'est là que se trouve la lumière.

Par le biais du consortium IDG, le NIH dirige l'effort mondial visant à guider les scientifiques vers l'exploration de protéines sous-étudiées, dont certaines seront certainement des cibles prometteuses pour de nouvelles thérapies médicamenteuses.

En fait, 2018 a été une année exceptionnelle pour ajouter de nouvelles pièces au puzzle : un record de 14 nouvelles cibles médicamenteuses est entrée sur le marché alors que de nouveaux médicaments ont été approuvés aux États-Unis, en Europe et au Japon. Et pour le moment, l'IDG a 400 pièces de puzzle "sombres" supplémentaires dans sa ligne de mire, avec d'autres percées attendues bientôt.

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